Un architecte moléculaire débutant commence sa carrière avec un salaire net d’environ 2 000 euros par mois. Avec de l’expérience, et en fin de carrière, cette rémunération peut atteindre jusqu’à 4 000 euros net par mois en fonction de l’industrie qui l’emploie, mais aussi de son ancienneté au sein de celle-ci. 

Une grille salariale est établie pour le métier d’architecte moléculaire, selon la Convention collective des industries chimiques et connexes. Dès l’obtention de son diplôme de niveau supérieur, le professionnel commence à exercer sa profession avec un coefficient de 350, représentant un salaire brut minimal de 2 672 euros (soit un taux horaire équivalent à 17 euros bruts environ). 

L’échelon le plus élevé pour un architecte moléculaire est 880. À ce titre, il se voit verser un salaire brut minimal de 6 718 euros mensuels (soit un taux horaire équivalent à 44 euros bruts environ). Cependant, le salaire moyen pour cette profession en France se situe entre 30 000 euros et 40 000 bruts annuels (correspondant à un salaire brut mensuel compris entre 2 500 euros et 3 500 euros).